Hace tiempo me tope con eso....Mira para usar fulltext en un query, primero tu campo debe de aceptar esa propiedad, entonces a la hora de la definicion tienes que indicarle eso, algo parecido a esto:
CREATE TABLE articles (
-> id INT UNSIGNED AUTO_INCREMENT NOT NULL PRIMARY KEY,
-> title VARCHAR(200),
-> body TEXT,
-> FULLTEXT (title,body)
-> );
Luego ya entonces cuando hagas un query para la busqueda fulltext ya funcionara..
Esta liga te ayudara mucho...
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/...xt-search.html
Saludos..
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