Se puede hacer una página ultrasegura?

[chepi]

Hola, estoy pensando en hacer para mi tesis de ing. informática una página web para la policía, que funcionaría en realidad como una "intranet" en "internet". Pero estoy un poco perdida.
mi gran duda es si utilizando php y mysql se puede obtener seguridad a toda prueba?
Qué cosas debo tener en cuenta? suponiendo que tengo un servidor muy bien configurado y la seguridad sólo dependiera de la página.

Cualquier idea o sugerencia será muy bienvenida!