Problemas con alert!!!

[kurlax]

Tu mensaje es muy extenso como para leerme todo el codigo, pero dada la pregunta creo que la solución consiste en lo siguiente:

opcion 1: Comprobar que los campos no estan vacios antes de enviar el formulario con una funcion Javascript asociada al evento onSubmit del formulario.
<form action=.... onSubmit="return comprobarCampos();">
<input name=campo1 id=campo1>
</form>
<script>
function comprobarCampos()
{
if (document.getElementById('campo1').value=="")
{
alert('El campo esta vacio');
return true;
}
else{return false;}
}
</script>

opcion 2: Tal y como lo tienes hecho, pero despues de scribir el alert puedes volver a escribir el formulario. Incluso te diría que esta forma es mas segura si quieres que realmente nadie ponga campos vacios en tu base de datos, porque el codigo JavaScript cualquiera se lo puede saltar.

Espero haberte sido de ayuda en algo.