Quieres comodidad para hacer backup de todo tu sitio? A lo mejor este script te sirve de ayuda. Así hago yo backups, uso un php q me realiza backups de las bases de datos a una carpeta especifica, y luego llamo a esta clase para comprimirlo todo en un zip el cual al final me descargo, jeje.
Compresor ZIP en PHP
Eso sí, siento no poder responderte a tu pregunta pues nunca he metido archivos en las bases de datos. Por eso me interesa saber las ventajas y desventajas ;)
Saludos!!