Cita: Lo hago así porque tengo separadas las partes de presentación, lógica de negocio y datos.
Ok .. pero dá igual esa separación si la propagación de datos en sí es por el URL (como se explica en la FAQ mencionada) o si es por una sesión. (No es que te esté obligando a que lo propagues en el URL .. las sesiones para tu caso son igualmente válidas).
Por lo demás no me has confirmado si las sesiones en general funcionan en tu aplicación o si has probado la sugerencia del "print_r()" para ver que contiene tu sesión ... Tampoco concretas si conocías el "detalle" sobre como trabaja los checkbox y por qué es conveniente contarlos (con count() a tu array) y no tener una variable extra para que tu indiques cuantos seleccionastes ... (En definitiva .. seguimos igual...)
Un saludo,