ya muchacos lo arregle :)
hay que modificar el run.php
Código PHP:
<?php
include "../includes/conectar.php"; //conexion.
$sqla = mysql_query(" SELECT * from usuarios"
." WHERE USER = '$_GET[pw]'");
if(mysql_num_rows($sqla)==1)
{
echo 'alert("El Usuario Ya Existe ")';
}
else
{
echo '';
}
?>