Si sólo necesitas cambiar una cadena específica (la coma) por otra cadena específica (los espacios), haz el reemplazo directamente con
str_replace() Código PHP:
$valores = "1,2,3,4,5";
$separador = " "; // O el que quieras
echo str_replace(',', $separador, $valores);//Cambiamos la coma por el $separador
Saludos
