Tienes la función:
register_shutdown_function()
http://www.php.net/manual/en/functio...n-function.php
Con eso disparas tu proceso desde el navegador e ignoras el "user abort" (que el usuario cierre esa ventana). El proceso seguirá corriendo en segundo plano. Lo malo será si ese proceso "falla" .. ahí tendrás que generar algún tipo de "log" hacia un archivo o BBDD para que puedas ver que pasó si tines problemas.
Yo la uso para enviar mailing's .. levanto el proceso por acción "manual" del usuario (un link que llame a mi script de proceso) ... registro el proceso bajo una función y la llamo con esta otra .. en el script en sí de proceso digo algo tipo "ya puede cerrar esta ventana .. procesando datos" .. Y por otro lado (ya que hago registro en una BBDD de lo que voy haciendo), puedo ir mostrando el estado de avance si corresponde.
Más sobre el tema en:
http://www.php.net/manual/en/feature...n-handling.php
Un saludo,