Si, si la hay
Publicando el SWF en EXE y haciendo un autorun.
El EXE lo obtienes publicando el FLA como Proyector de Windows.
autorun.inf
Código:
[autorun]
icon=TU_ICONO.ico
open=TU_APLICACION.exe
Todo lo que tienes que hacer, es poner el archivo autorun.inf junto a tu ejecutable, los metes a tu USB y listo !!!