Cita: El sitio trabaja con MySQL. Que se hace en estos casos que solo es consulta? Hay algun intermediario entre las dos bases datos, sin llegar a poner en riesgo los datos pues no manejo muy bien la seguridad... ?
Pues se ejectua la consulta SQL simplemente simplemente.
Si quieres seguridad .. usa SSL para el transito de datos entre cliente y servidor, dond en ese caso viajan encriptados. El SSL es una capa de seguridad que no depende de PHP sino de tu servidor HTTP .. para PHP es transparente.
También .. ya que dices que vas a sólo consultar a tu BBDD no está de más usar usuarios de Mysql (sí, el que usas para conectarte a tu BBDD desde tus scripts PHP) con permisos sólo de ejecuciòn de sentencias SQL tipo "SELECT" y poco más .. es decir, ajustar los privilegios del usuario sobre la BBDD o tablas que corresponda (esto tampoco lo haces con PHP directamente, lo haces al crear el usuario de Mysql que quieras usar).
Un saludo,