Hola opeth, me encanta que haya alguien preguntando por la semántica.. ¡BRAVO!
Cita:
Iniciado por opeth 
<abbr> no significa nada para IE
No entiendo este punto.. lo que hace IE es no subrayarlo, pero eso se soluciona con CSS. El title claro que lo muestra... pero igual, una recomendación: OLVIDATE de los navegadores. Si uno búsca la semántica, no puede estar pendiente de lo que hace o deja de hacer el navegador A, o el B, etc.. porque si no, uno va en contra de la propia semántica que se está buscando...
Cita: 2. ¿No esta de mas el elemento <strong>? dijo con <em>
em da énfasis (itálica),
strong da un énfasis aún más fuerte (negrita)..
Cita: cual es el significado de cada cosa?
Creo que un texto en lipsum no es lo mejor para ilustrar algo semántico
Mirá este ejemplo:
Código HTML:
<p>Como alguien dijo en <cite>Foros del Web</cite>: <q cite="http://www.forosdelweb.com">Windows Vista busca compatibilidad con Firefox</q></p>
p -> párrafo
q -> texto que se cita, cuando es un texto inline (osea, menos de 1 párrafo)
blackquote -> igual que q, pero para textos en bloque (citas largas)
cite -> Contiene una cita o una referencia a otras fuentes
CITE se usa en dos formas, como un atributo con valor una url o como un elemento.
Cita: IE no hace ninguna diferencia visual cuando lo "renderiza".
Todo lo visual -> CSS. Además si hay gente que quiere usar un navegador defectuoso, no es culpa tuya..
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HTML, lenguaje de marcas
Espero haber aclarado la mayoría de tus dudas...