puedes hacer:
Código PHP:
echo "<input name='imagen' type='file' class='cajasTextoCursos' id='imagen".$prefijo."'>
";
siendo $prefijo cualquier valor sacado de la base de datos: la id, o cualquier dato relacionado con la imagen que pueda diferenciarla de otra.
con la id el resultado sería:
<input name="imagen" type="file" class="cajasTextoCursos" id="imagen1">
<input name="imagen" type="file" class="cajasTextoCursos" id="imagen2">.
...
prueba a ver si con eso te vale