Seguramente habrás utilizado valores absolutos, es decir, cierto número de pixeles para izquierda, derecha, alto y ancho. Prueba usando valores relativos (un porcentaje %).
Ejemplo:
Si colocas una capa en ancho 400px estará en el medio en un monitor a 800x600, pero en uno a 1024 no. Si lo pones 50% SIEMPRE estará en el medio.
espero te sirva
