Pues no se si entendi bien tu problema pero ahi te va este código:
<?php
$numeros = explode(" ","1 5 8 10 25");
$separar = explode(' ',"1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31");
echo "<center><font size=2 face=arial><b>";
for ($i = 0; $i < count($separar); $i++)
{
$color = "#000000";
for ($j = 0; $j < count($numeros); $j++)
{
if ($numeros[$j] == $separar[$i])
$color = 'orange';
}
echo "<b><font color = '".$color."'>".$separar[$i]."</font></b> ";
}
echo "</b></font></center>";
?>
Pruebalo a ver si te es de alguna utilidad, o te da alguna idea.