tienes que hacer un backup de las bases de datos(si tienes) y los archvios. y ya
si usas el php myadmin puede que tengas porbelemas con los archivos grandes o bases de datos grandes te recomiendo que hagas pruebas respalando la infromacion y en caso qeu sea muy grande de poco a poco..
ahy maneras mas faciles como hacerle un backup a toda la base de datos pero algunos host no te lo permiten busca si es posibele hacerlo en el tullo
sobre los archivos si manitnes el mismo dominio, solo fijate en los persmisos en las carpetas en caso de que los allas modifciado..