¿Crear una máscara con una partícula? Bueno, hay máscaras en el Particle, pero algo así como usar la partícula como máscara, pues no... Así como entiendo la pregunta es similar a usar un pincel de máscara en Photoshop... o cómo va la cosa???
Si tienes un efecto de agua, y quieres enmascarar una zona del efecto, entonces usas una máscara, en la parte de arriba tienes los bloqueadores, fuerzas y máscaras...
Dar profundidad, pues, con los valores de tamaño y cantidad. Te recomiendo darle una ojeadita al manual que trae el programa, es bastante bueno, y hasta donde se no hay otro mejor (ni en español), con algo d entendimiento podrás manejar a muy buen nivel el programa.