lo mejor si lo queres dar en un formato razonable (minutos o incluso segundos) es un javascript que cuente los segundos... Esto por un lado
Por otro lado, cuando el usuario entra en sesion usas time() para saber la hora UNIX, y la almacenas en una DB por ejemplo... Y despues a cada vez que el usuario entra a una pagina, loadeas este timestamp desde la db, haces la diferencia con el actual.. Y sabes cuanto tiempo llevaba cuando abrio la pagian...
Ahora este valor lo pones como valor inicial en el javascript, para que siga contando... Hace falta un poco de manejo de sesiones nada mas...
Saludos
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