Pareciera ser que deberias asignar en vez del tamaño 100% de alto y ancho asignar un tamaño "proporcional" al SWF original para que no muestre franjas de "relleno".
puedes por ejemplo con javascript generar el width y height :
El codigo siguiente te redimensioanara tu SWF cada vez que carge o se redimensione la pagina. Espero te sirva... (no ta en rojo algunos cambios en tu codigo)
<object
id=flash1 classid="clsid:D27CDB6E-AE6D-11cf-96B8-444553540000"
codebase="...." width="100%" height="100%">
<param name="movie" value="Intro.swf">
<param name="quality" value="high">
<param name="SCALE" value="noborder">
<param name="LOOP" value="false">
<embed
id=flash2 src="Intro.swf" quality="high" pluginspage="....." type="application/x-shockwave-flash" width="100%" height="100%"></embed></object>
<SCRIPT>
function resizeflash(){
f=document.getElementById("flash1");
f.width=document.body.clientWidth-10;
f.height=f.width*615/980;
f=document.getElementById("flash2");
f.width=document.body.clientWidth-10;
f.height=f.width*615/980;
}
window.onresize=resizeflash;
resizeflash();
</SCRIPT>