Hola gonzalocastillo:
En realidad los comentarios, no influyen en el código, pues son eso, comentarios. Lo que pasa es que hacen mas facil de entender al codigo, ya sea explicando que entra y que devuelve una funcion o explicando el algoritmo en si (seguramente ya lo sabias).
Los @private (acceso privado), @return (lo que devuelve el metodo o funcion), son tags especiales para documentar tus clases. Hay aplicaciones tales como phpdoc, o phpedit (si no me equivoco), que apartir de tu codigo y estos tags te generan la documentacion de tu clase. O sea, describen todos lo metodos de la clase, variables y demas. Esto es originario de java, el cual tiene una herramienta llamada javadoc que hace el mismo trabajo.
Enlaces relacionados al tema no conozco, pero puedes visitar:
<a href='ir.asp?http://phpdocu.sourceforge.net' target='_blank'>http://phpdocu.sourceforge.net...</a>
y creo qeu en <a href='ir.asp?http://www.phpbuilder.com' target='_blank'>http://www.phpbuilder.com...</a> hay otra aplicacion similar, o por lo menos la comentan.
<a href='ir.asp?http://www.phpedit.com' target='_blank'>http://www.phpedit.com...</a> Uno de los mejor IDEs para php.
y por ultimo en <a href='ir.asp?http://www.sun.com' target='_blank'>http://www.sun.com...</a>
Bueno, espero haber aclarado tu duda.
Saludos
<img name="Firma" src="http://www.jpw.com.ar/FirmaNok.gif" border="0" usemap="#Mapa"><map name="Mapa"><area shape="rect" coords="0,43,174,60" href="http://www.jpw.com.ar/noktemplate"></map>