Me puedes explicar con manzanitas plis
"Estas bajando un video" de internet o a la compu? por medio analógico o digital?
"el audio de entrada esta en dos canales" idem, de dónde sale el clip, como sabes que el audio esta en canales diferentes o en capas difentes?
"el Premiere solo te lo captura" es decir, sí es captura digital? de varios canales de audio??
Luego entonces, te puedo dar una posible solución.