Intenta cambiar de fomrato esos mp4 a mpeg usando el Media Coder, no creo que te baje la calidad que de por sí ya es baja por el formato, luego ese mpeg ya lo podrás usar en el Vegas.
Y parece que el problema de no lectura de avis es por una falta de codecs, puedes usar el GSpot para averiguar qué codec son las pelic que no abren y bajar ese codec