Cita:
Iniciado por Mikmoro 
¿Cómo afecta esto a tu caso? Tú pones una caja de 54px, y le das un borde de 1px. Luego metes dentro un elemento que nuevamente tiene 54px.
Ah, disculpa. Pues creo que hay algo de mi respuesta que no estás entendiendo, y que imagino que no has probado.
En IE, la caja ya no mide 54px, sino 52px. Si metes dentro cualquier otro elemento mayor que eso, la caja crecerá para adaptarse al contenido (cosa que no hacen el resto de navegadores). Significa esto que si tú ahora metes un elemento "a", con display block y un tamaño de 54px, la caja que medía 52px se ve agrandada por el link de 54px, y ahora el conjunto mide 56px.
Eso hace que tengas un desborde de 2px de un "li" con link sobre otro sin link. Pero no es por el link; mete cualquier otro elemento al que hayas dado un display block y una altura de 54px y te pasará lo mismo.
¿Has probado lo que te he dicho de reducir el link a 52px por 215px? Es que a mi se me iguala sin ningún problema.
Mikel.