Base de datos COLGADA por QUERY lento

[mafima]

Hola, primero decirles gracias por su ayuda.

tengo una Base de datos en un servidor dedicado, esta tiene mucho trafico, pues son muchas las visitas, lo que sucede es que la base de datos se esta quedando colgada una o dos veces en el dia, es decir, si CUELGA y tenemos que reiniciar la Base de datos MySql.

Quienes manejan el servidor, dicen que se esta quedando bloqueada la base de datos por un QUERY es un INSERT INTO, entonces quiciera saber cuales son las posibles causas y las posibles soluciones:

1. Una solucion que se me ocurrio es encontrrar una manera de hacer que cuando el query se este tardando mucho entonces lo TERMINE, pero no se como hacer esto....

Alguien me puede ayudar? hay alguna otra manera de solucionar esto?
POr que puede ser que el QUERY este presentando este problema?

De antemano muchisimas gracias, espero sus respuestas.