Para los subtítulos, necesitas un programa reconocedor de caracteres (OCR), el más utilizado es SubRip:
www.mundodivx.com/subtitulos/subrip.php
En cuanto a lo del sonido, te recomiendo probar Gordian Knot o Auto Gordian Knot, con el primero hay que trabajar bastante su configuración pero da muy buenos resultados, mientras que el segundo es similar pero muy automatizado. Si con ellos no consigues que el audio te salga sincronizado, no hay problema, puedes
sincronizarlo 