Si tu servidor remoto te deja hacer conexiones remotas (no en modo local en el servidor .. Internet) ..
Puedes usar software como Mysql-Front . para Windows que va hace ese tipo de operaciones (conectasa a dos servidores diferentes y ahi haces lo q tengas q hacer como . duplicdos etc).
<a href='ir.asp?http://www.anse.de/mysqlfront/' target='_blank'>http://www.anse.de/mysqlfront/...</a>
Y sino . .a mano . te guardas la estructura y datos de tu LOcal . y se lo subes a tu remoto via phpmyadmin o algun gestor similar que tengas en tu servidor remoto ..
Un saludo,