si estas utilizando un link del modo:
<a href="la pagina de inicio">inicio</a>
la pagina se abrira en el marco en que este el link, osease, en el menu.
Para que un link se abra en otro lugar, puedes indicarlo mediante el atributo
target, haciendo referencia al marco padre "
parent", o de manera mas precisa al marco superior "
top", en ambos casos se indica precedido de un guion bajo:
<a target="_top" href="la pagina de inicio">inicio</a>"
que abriria la pagina de inicio, reemplazando a los tres frames.
salud os