Visual MP3 Splitter & Joiner es un shareware pero se dedica a eso... O con cualquier editor de audio... (sería mi recomendación)
MPEG Audio Scissors 1.4 es free, dice que hace eso...
El Jet Audio dice que corta pero no une según su sitio web...
Aclaro que no he usado ninguno, solo estoy googleando... Yo uso programas editores como el Audition