Aquí un manualito para que manejes mejor el VirtuDubMod.
De todas formas es simple... Abres el archivo, Te vas a File -> File Information, y ves cuánto tiene la peli de Bitrate, luego te vas a Video -> Compression, y ahí selecionas el codec y en sus ajustes ingresas el mismo número de bitrate. Te vas a File -> Save as y listo, comienza la codificación. Pero revisa el manualito para que te quede todo más claro.