El Mokey es el que hace eso :P O a mano con el efecto Offset usando After Effects que es el que uso, o Combustion...
Ok, si el error es el mismo en compus diferentes, no creo que sea el programa o la configuración, pueden ser los clips de video... Dices que sucede lo mismo si usas el SUPER o el VirtualDubMod, pero me queda la duda del origen de esos clips, en qué formato vienen?... Tienes una muestra que me envíes, no del Youtube, para hacer la prueba en codificación e importarlo en el Mokey, a ver qué sucede...