seguramente sea porque la suma del ancho de los divs sobrepasa el ancho del div contenedor
fijate algo asi
Código HTML:
<div id="contenedor" style="width: 100%">
<div id="izquierda" style="float: left; width: 49%">
<? @include('show_afiliados.php'); ?>
</div>
<div id="derecha" style="float: right; width: 50%; color:#000000">
<?php ssi_quickSearch(); ?><br />
<?php ssi_logOnline(); ?><br />
<?php ssi_boardStats(); ?>
</div>
</div> de no ser esto lo que queres, postea el codigo de tus div que le buscamos una solucion :P