sencillo
el atributo HEIGHT para las tablas
no existe en HTML 4
además:
a) Mi olfato me dice que estas usando las tablas para diseñar. Estaría bueno que vieras
porque eso esta mal y no es recomendable.
b) Acostumbrate a separar la información del diseño. Todo lo que sea diseño (tamaños, posiciones, colores, etc) definilo con CSS
c) en CSS cuando definis el height como un %, es un % del ELEMENTO PADRE. Por lo tanto en este ejemplo de la tabla si lo hicieras con CSS, tendrías que definir la altura del elemento HTML (que es el elemento padre de todos los demás) también como 100%