podrias publicar un screenshot para ver bien que es lo q sucede???
te recomiendo coloques esto en tu web
<body Scroll="NO">
<div align="center">
//dentro de este div colocas el object flash,
//y en las propiedades del object:
width="800" height="600">
<param name="quality" value="high" /><param name="SCALE" value="exactfit" />
<embed src="movie.swf" width="800" height="600" quality="high" pluginspage="http://www.macromedia.com/go/getflashplayer" type="application/x-shockwave-flash" scale="exactfit"></embed>
</div>