Hola,
Cuando hago la publicación del HTML desde Flash en ocasiones me pasa lo mismo que a ti, incluso yo veo bien el HTML en local pero en el servidor no se ve nada. Opté por no hacer los HTML desde Flash por lo que te recomiendo que pruebes insertar el SWF en HTML con Dreamweaver o algún otro programa; o bien, hacerlo de forma manual con el código similar a este:
Código HTML:
<object classid="clsid:D27CDB6E-AE6D-11cf-96B8-444553540000" codebase="http://download.macromedia.com/pub/shockwave/cabs/flash/swflash.cab#version=7,0,19,0" width="115" height="230">
<param name="movie" value="MenuPrincipal.swf" />
<param name="quality" value="high" />
<embed src="MenuPrincipal.swf" quality="high" pluginspage="http://www.macromedia.com/go/getflashplayer" type="application/x-shockwave-flash" width="115" height="230"></embed>
</object> Saludos.