Imagino que se refiere a que si tu proyecto es PAL la resolución del mismo es 720x576, y si es NTSC es de 720x480, con lo cual si metes un vídeo con otra resolución lo adaptará a una de esas... Solución, pues meter los vídeos en la misma resolución que tengas configurado el proyecto, o bien deja que el programa lo cambie y mira qué tal queda.