Holas...
Primero debes incluír un código javascript en tu index para que abra la ventana pop-up al cargarse, dentro de la ventana pop-up estará el flash que quieres mostrar (o un html que lo contenga), y una vez que finalice la animación, el último frame tiene como acción el código que hace cerrar la ventana.
Así lo haría yo......no sé si te sirve de algo la ayuda....
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