Hola SubZero_mb! Yo estuve trabajando un tiempo con prototype y es bastante completo, posee muchas herramientas que se le pueden ir agregando y aparte cuenta con scriptaculous. Tambien estuve viendo algo de Dojo, particularmente creo que este último es mucho mas potente.
Espero que te sirva de ayuda!
Saludos
El Chalo
