bien haz lo siguiente y mas facil, dale doble click al archivo fcsh.exe que esta tu directorio bin
se abre una ventana de comandos ok ahora despues de <fcsh>
escribe mxmlc deja un espacio y arrastra el archivo .as que quieras compilar ***.as y luego enter automaticamente el compilador le va a asignar una id en este caso 1
quedaria asi
<fcsh>mxmlc c:/larutadetuarchivo/tucodigo.as
si todo sale bien no va a dar errores y se va a crear un swf, si haces cambios en el as original simplemente regresas al compilador y escribes compile 1 (esto es muy beneficioso por que guarda datos en cache y lo compila a la velocidad de la luz), obviamente si hay errores de compilacion te va a decir que errores hay , y en que linea...
Saludos
Un punto mas, tienes que tener instalado el runtime de java tambien , descargalo de aca:
http://java.sun.com/javase/downloads/index.jsp
descarga e instala: Java Runtime Environment (JRE) 6 Update 5
(es el runtime no descargues el sdk a menos que quireras programar en java tambien).