Hola,
Nunca he usado campos de tipo TIME en MySQL, pero en el manual pone que admite valores de -HHH:MM:SS a HHH:MM:SS, y dice especificamente que acepta valores mayores de 24 horas, asi que si lo puedes usar. Aunque no se si se pueden usar con el resto de funciones de tiempo.
Para crear la cadena a guardar usa sprintf (ver manual <a href='ir.asp?http://www.php.net/manual/en/function.sprintf.php' target='_blank'>http://www.php.net/manual/en/function.sp...</a>) Lo que hace es devolverte una cadena formateada. No se si luego puedes usar esa cadena con las funciones de tiempo de PHP.
Espero haber sido de ayuda.
Josemi
Aprendiz de mucho, maestro de poco.