Lo único que se me ocurre es que uses anchors (anclajes)
Dentro de la página que muestras dentro del Iframe, pon un elemento con ID:
Código HTML:
<div id="loquequieras"></div>
Y la web que llamas desde el Iframe, que sea:
Código HTML:
<iframe src="web.html#loquequieras" ...
Al menos, saldrá el objetivo a la altura que buscas.
Un saludo.