soy usuario nuevo en linux(usando ubuntu), no he tenido ningun problema de virus, hasta ahora, pero no descarto la posibilidad, y con windows tuve minimos y estuve años trabajando con este, yo soy de la idea de que los SO son tan seguros como el usuario que los controla tenga conocimientos de seguridad(al menos de no abrir o instalar nada que no sea de una fuente confiable), lo que pienso es que el win al ser tan atacado en algún momento caera en las garras de los virus(llamense troyanos, spyware, etc.) y tambien porque deja muchos lugares bulnerables y que un usaurio comun(de los que solo usan office, ie y una que otra utilidad) no le presta atención de lo que pueda pasar, muchos piensan que por tener un ativirus ya no tendran problemas y eso es un grave error, en resumen la seguridad del SO es responsabilidad del usuario y no del equipo.
esta es la humilde opinion de un usuario casi comun
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saludos.