Movería tu tema al depertamente de soporte de Google pero no tengo ese poder de moderación
Se supone que Google Video hace la conversión en su sitio, si te acepta el video, pues vale, malo que no te lo aceptara... si no te lo aceptara, entonces sí, habrá que ver qué se le hace a tu video, pero si te lo acepta ya es problema de Google, supongo... Además, con la fusión de Google y Youtube, el Google video comenzó a dejarse de lado por usar Youtube, no creo que den mucho soporte sobre el sitio... Pero en definitiva, es problema de allá si te acepta tus videos... De todas formas, si codificas como codifiques, allá se recodificará y si tienen problemas, da lo mismo qué le hagas al video... Me expliqué o te enredé más?