Bueno las paletas de colores te ayudan a decidir de que manera vas a poder combinar tus colores, claro que nada esta dicho, tu puedes ocupar los colores de la manera que mas te agrade, pero para esto debes tener algo de noción de que son los colores y estudiar un poco sobre ellos para que puedas tener un mejor acercamiento a quien te diriges, ahora los porcentajes son por ejemplo, si usas un verde al 100% podrías usar ese mismo verde al 50% para ponerlo en alguna parte de tu diseño así lo usarías como si fuera otro color, hay muchas maneras de usar los colores pero te recomiendo que leas un poco sobre ellos aquí te dejo algunos artículos..saludos
http://www.fotonostra.com/grafico/contrastestono.htm http://www.webusable.com/coloursMean.htm#amarillo Factor de equilibrio