Hola Dundee:
A mi también se me hace difícil. Pero comparto contigo mi 'metodo' de comprensión.
Los div que mencionas los utiliza para dar fluided al diseño, tanto en horizontal como en vertical: si cambias el color de fondo a cada uno de esos div verás que los tres llegan hasta el pie de página.
Te explico cómo me las arreglo yo:
Supongo que usas firefox y conoces
firebug o webdeveloper.
Bien, su uso es extremadamente instructivo. Te posicionas con el ratón sobre cualquier elemento de la página, haces click derecho y seleccionas 'Inspeccionar elemento', abajo te van a aparecer tanto el css como el html, y ahora viene lo bueno: puedes alterar todo lo que quieras sin miedo, verás los cambios en tiempo real en la pantalla, y llegado el momento del desastre total: F5 - Recargar y a volver a empezar.
Es de lo más divertido
jugar con firebug.
No desesperes, solo es cuestión de:
1º: hacer copias de seguridad te tus trabajos.
2º: darle un tamaño suficientemente grande a la papelera
Un saludo.