Mírate el .htaccess y la configuración del mod_rewrite. Podrías hacer que si la URL comienza por "blog." se acceda directamente al subdirectorio "/blog".
Por otro lado, comprueba la configuración de subdominios de tu servidor. Te lo digo porque en mi caso los subdominios se instalan en diferentes directorios que el web principal. Así no hay problemas de que se "mezclen" los ficheros y no es necesario inventar nada para que se separen. Por ejemplo:
-
www.dominio.com - Está en el directorio /xxxxx/web
- blog.dominio.com - Está en el directorio /xxxxx/subdomains/blog
- foros.dominio.com - Está en el directorio /xxxxx/subdomains/foros
De esta manera, es el propio servidor web el que separa los subdominios y no hay que preocuparse de qué URL es la de entrada