Cuando pasar un archivo a PDF si el que filma lo hace con tu PDF y aun estando las fuentes en la cabecera si el no tiene las fuentes o el rip no las reconoce pasan esos errores, el rip no es un interprete.
En lo personal rasterizo los PDF cuando se filman cuando menos a 150 lineas, con los siguientes parametros de pshop.
http://img384.imageshack.us/my.php?image=nuevo1cc2.jpg
Y como veras no se pixela absolutamente nada.
http://img356.imageshack.us/my.php?image=nuevo2te9.jpg http://img73.imageshack.us/my.php?image=nuevo3nw4.jpg
Esta visualizacion la logras con la lupa y la opcion de actual pixels
De 150 - 200 lineas los textos parecen vectoriales y en CTP ni hablar, lo que si es que lo puedes grabar como TIFF o PSD segun sea el caso.