Creo que lo mas adecuado seria lo siguiente:
Código:
<style type="text/css">
.linea {
height:1px;
background-color:#000099;
overflow: hidden;
}
.linea hr {display:none;}
</style>
</head>
<body>
<div class="linea"><hr /></div>
</body>
</html>
De esta manera se mantiene la funcion semantica del HR y se logra visualmente lo que quieres.