Con las funciones de PHP para tratar directorios/ficheros ...
http://us.php.net/manual/en/ref.dir.php http://us.php.net/manual/en/ref.filesystem.php
Tienes funciones como opendir() ..para comenzar la lectura de directors/ficheros de un directorio .. y varias más.
mira los ejemplos de los "user coments" (comentarios de los usuarios del manual de PHP) hay códigos de ejemplo bastante útiles.
Un saludo,