Via PHP puedes conectar a SQL Server con las funciones nativas que PHP tiene para gestionar SQL server:
http://us.php.net/manual/en/ref.mssql.php
(presta atención a los detalles de configuración de PHP .. para dar soporte a PHP de esas funciones tienes que instalar/configurar esas librerias que ahí se menciona)
A todo esto .. especifica si el servidor HTTP con PHP y el servidor SQL server estan en la misma makina o en diferentes .. ademas de los sistemas operativos que usen ambos ..
Te lo menciono porque .. si estan en una misma makina y es windows . no hay problema. Si PHP está en LInux y SQL server en otra makina .. ahi se empieza a complicar (pero hay solución) ... etc, etc ....
Tambien puedes conectar via ODBC a SQL server .. pero con las funciones nativas de PHP para MS SQL server irá mucho mejor en cuanto a rendimiento.
Un saludo,