mira la verdad que yo no te entiendo muy bien, pero lo que te decía en mi anterior post es que tienes todo mal estructurado por ejemplo modifique un poco el contenido, checkalo haber si te sirve para mejorarlo, ahh y lo que te digo de los 1000px y que no debes utilizarlo, puedes probarlo haciendo mas chica la ventana de tu navegador para que veas el efecto, ojo no adaptes el código, copialo y pegalo en un archivo nuevo para ver si es lo que necesitas:
Código:
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/*contenido de la columna derecha*/
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Código HTML:
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<div id="logo"><h1>S</h1></div>
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espero te sirva de algo..