Bueno esta pregunta la conteste en la Faqs Dando la Solucion de Usar :
Código:
System.useCodePage = true;
Pero solo Funciona en las PC's es Decir en las mac's No va.
como bien comenta fireifa es mejor guardar el Documento de texto como Unicode o UTF-8.
Te dejo un Link donde Rolf Ruiz habla sobre el tema con mas profundidad.
Caracteres Especiales
Saludos!!
